Αρκετά δύσκολα ήταν τα πρώτα χρόνια του Λευτέρη Ελευθερίου στην ΑΕΚ. Και αυτό λόγω των σοβαρών τραυματισμών που είχε.
Ο ίδιος μιλώντας για το όλο σκηνικό στο Podcast Talks, είπε:
«Πέρασα δύσκολα στην ΑΕΚ τα πρώτα 3-4 χρόνια. Ειδικά με τους τραυματισμούς. Το 1996 με άφησε τραυματισμός δυο χρόνια έξω με τρεις συνεχόμενες εγχειρίσεις. Υποτίθεται πήγαμε στον καλύτερο γιατρό της Ελλάδας τον Νικολάου. Πήγαμε στον Λάκη Νικολάου για την εγχείρηση του μετατάρσιού. Το 96 έπαιξα τα 3-4 τελευταία ματς και μετά έσπασε πάλι και συνέβη 5-6 φορές αυτό.
Μετά πήγα στον Πρίφτη, τον γιατρό του Ολυμπιακού και πήγαν όλα καλά και μετά άρχισε η ανοδική μου πορεία και η σταθεροποίηση. Τόσο εμένα όσο και της ομάδας με τον ερχομό του Ντούσαν Μιτόσεβιτς το 2000 όπου είχα βάλει 21 γκολ. Μετά άρχισε μία εξαετία γεμάτη με πολλά γκολ και επιτυχίες με αποκορύφωμα την κατάκτηση του κυπέλλου».
